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ホーム >> 探索・基礎研究 >> ケモ・インフォマティクスソフトウェア:Sarchitect
 




メディビックとStrand Life Science社では、創薬現場の声を反映したQSARモデリングソフトSarchitectを共同開発しました。Sarchitectをプラットフォームとし、化合 物構造情報からADME/Toxパラメータや結合パラメータ等を予測できるソリューションを提供しています。
Sarchitectを利用したモデル構築支援や、独自予測モデルの受託構築サービスも行っております。
ストランドライフサイエンス社はインドのバンガロール(Bangalore)を拠点とし、データマイニング、視覚化、予測モデル、ナレッジ・マネジメン ト、ワークフロー管理などの技術を駆使して医薬品の研究開発を支援するためのソフトウェアの開発やコンサルティングサービス行っています。米国カリフォル ニアにも営業拠点を持ち、その高度な技術と応用性につき高い評価を得ており、既に、欧米の大手製薬企業やバイオベンチャー企業、大学研究組織などとの契約 の実績を誇っております。
・ワークフローによるユーザガイド
→ ワークフローによる操作ガイドによって、簡易に値予測、モデル構築
・汎用的な3D構造最適化/2D、3D-Descriptors生成モジュール搭載
→ MMFFを力場とする3D構造最適化ロジックを搭載し、1000以上のDescriptorsを算出
・リッチなグラフィック
→ 予測結果やPCA(主成分分析)などのグラフは、すべてダイナミックにリンクされており、一つのグラフや表での変更が全てのグラフや表にも瞬時に反映
→グラフはイメージファイルとして、表データはCSVファイルやTextファイルとして出力でき、会議資料や文献データ料としてご利用可能
・グローバルモデルとして、ヒトPK予測モデルtruPK, 毒性予測モデルtruToxを提供しています。
・化合物構造情報を入力するだけで、ADME/Toxパラメータを予測できます。

ヒトPK予測モデル truPK
予測モデル単位概要
Plasma Protein Biding%薬が血漿タンパクに結合する割合
Bioavailability%投与された製剤中の薬物が体循環血液中に達する割合
Volume of DistributionL/Kg生体内での薬物の分布の程度を示す仮想上の容積体内薬物量=分布容積×血中濃度
Elimination Half-lifeHours薬物の血中濃度半減時間
Rate of Absorption1/Hours経口投与された薬が、単位時間当たり、どれだけ血中に達するかを示す
毒性予測モデル truTOX
予測モデル単位概要
hERG Chanel Binding (50uM)BINDER/
NONBINDER
hERGチャネルへのIC50値が501uM以下である場 合:BINDER
50 uMより大きい場合:NONBINDER
   
・多彩な機械学習アルゴリズムによるローカルモデル構築
 −featureランク付け
  ・ANOVA
  ・Kruskal Wallis
 −featureサブセット選択
  ・遺伝的アルゴリズム
  ・変数増加法(Forward Selection)
  ・変数減少法(Backward Elimination)
 −クラス分類アルゴリズム
  ・ニューラルネットワーク
  ・Support Vector Machine
  ・決定木
 −回帰アルゴリズム
  ・重回帰分析
  ・ニューラルネットワーク
・ChemAxon社製モジュールを搭載しており、Sarchitect上で化合物デザインや修正が可能
予測精度が要求されるリード化合物最適化プロセスでは、プロジェクトに特徴的なデータのみを用いたローカルモデルや、複数のモデルを組み合わせることで、in silicoモデルが活用されています。

以下のカスタムモデル構築サービスを提供しています。

 ・ローカルモデル構築サービス
 ・独自モデル構築サービス
 ・技術コンサルテーション
WindowsLinux
OSWindows NT4.0、Windows 2000、Windows XPLinux 2.2.1以降
メモリ512MB以上推奨512MB以上推奨
ハードディスク使用容量100MB100MB
ハードディスク使用容量16MB以上16MB以上
   
試用版(無料)もご用意しています。
Strand Life Sciences社
Strand Life Sciences社:Sarchitect
データマイニング受託サービス
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