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・多彩なアルゴリズムにより、直接相互作用、最短経路、想定される標的分子や調節因子などの相互作用ネットワークの構築を実現
・多彩なフィルタリング機能により、関連性の高い相互作用の絞込みとネットワークの簡素化が可能 |
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・文献情報から得られた約150万件の生物学的情報を蓄積
・分子間相互作用データベースBINDやMINTなどを含むキュレーションされたデータソース
・各種公共アノテーション情報(Entrez gene annotation、synonyms、subcellular locations、gene
ontology terms、microarray IDsなど)
・酵母two-hybridや遺伝子スクリーニングデータなど、in-houseのデータインポート機能を搭載 |
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・分子間相互作用を解明するために、完全にカスタマイズしたBINやRINのグラフィックを描画
・追加、修正、削除、移動、ハイライトなど、自由に編集可能
・様々なファイルフォーマットで、高品質の画像をエクスポート可能
・BINやRIN上へマイクロアレイ遺伝子発現データを反映させることが可能
・BINやRINはHTML形式で遺伝子アノテーションや参考文献とのリンクを維持したままエクスポートや共有が可能
・オルガネラや分子の局在を反映させた画像を用いた視覚化が可能
BIN:Biological Interaction Network
RIN:Relevance Interaction Network |
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・次世代自然言語処理(NLP:Natural Language Processing)エンジンによる、生物学的テキストからの情報を抽出
・二次的なマニュアルキュレーションによる信頼性の向上
・PathwayArchitectTM内に搭載された相互作用データベースとローカル自然言語処理エンジン
・カスタムキュレーションエンジンを搭載したエンタープライズテキストマイニングシステムも対応可能 |
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・BINの結果をもとにしたRINの解析により、目的のパスウェイの重要性を推測
・統計的有意性の向上を考慮したRINの構築プロセス
・関連ネットワークの解析によるBINの拡大
・あらゆるノードに対し関連性を計算し、パスウェイの信頼性を向上 |
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・最新の文献情報よるBINの簡単アップデート機能
・各相互作用に関する参考文献や要約へのハイパーリンク機能
・BINで描画した相互作用をサポートする全ての参考文献は、簡単にEndNote参考文献ライブラリーにエクスポート可能
・PubMedの要約、全文、内部文書などからの生物学的相互作用の抽出 |