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ホーム >> 探索・基礎研究 >> パスウェイ解析ソフトウェア:PathwayArchitectTM
 


  お知らせ

 2008年6月30日(月)をもって、当ソフトウェアの販売、及びテクニカルサポート業務を
 終了させて頂きます。 詳細はこちらをご覧ください。

 
多彩なアルゴリズムを搭載。革新的データマイニングツール、ビジュアライズツールを備えたパスウェイ解析ソフトの決定版PathwayArchitectTM が新登場しました。タンパク質、低分子、酵素、タンパク質ファミリーなどに関する150万の相互作用のデータベースおよびin-houseのデータベースの情報をもとにした生物学的機能解析を実現します。
・多彩なアルゴリズムにより、直接相互作用、最短経路、想定される標的分子や調節因子などの相互作用ネットワークの構築を実現
・多彩なフィルタリング機能により、関連性の高い相互作用の絞込みとネットワークの簡素化が可能
・文献情報から得られた約150万件の生物学的情報を蓄積 
・分子間相互作用データベースBINDやMINTなどを含むキュレーションされたデータソース  
・各種公共アノテーション情報(Entrez gene annotation、synonyms、subcellular locations、gene ontology terms、microarray IDsなど)  
・酵母two-hybridや遺伝子スクリーニングデータなど、in-houseのデータインポート機能を搭載
・分子間相互作用を解明するために、完全にカスタマイズしたBINやRINのグラフィックを描画  
・追加、修正、削除、移動、ハイライトなど、自由に編集可能  
・様々なファイルフォーマットで、高品質の画像をエクスポート可能  
・BINやRIN上へマイクロアレイ遺伝子発現データを反映させることが可能  
・BINやRINはHTML形式で遺伝子アノテーションや参考文献とのリンクを維持したままエクスポートや共有が可能  
・オルガネラや分子の局在を反映させた画像を用いた視覚化が可能  
BIN:Biological Interaction Network  
RIN:Relevance Interaction Network
・次世代自然言語処理(NLP:Natural Language Processing)エンジンによる、生物学的テキストからの情報を抽出
・二次的なマニュアルキュレーションによる信頼性の向上
・PathwayArchitectTM内に搭載された相互作用データベースとローカル自然言語処理エンジン
・カスタムキュレーションエンジンを搭載したエンタープライズテキストマイニングシステムも対応可能
・BINの結果をもとにしたRINの解析により、目的のパスウェイの重要性を推測
・統計的有意性の向上を考慮したRINの構築プロセス
・関連ネットワークの解析によるBINの拡大
・あらゆるノードに対し関連性を計算し、パスウェイの信頼性を向上
・最新の文献情報よるBINの簡単アップデート機能
・各相互作用に関する参考文献や要約へのハイパーリンク機能
・BINで描画した相互作用をサポートする全ての参考文献は、簡単にEndNote参考文献ライブラリーにエクスポート可能
・PubMedの要約、全文、内部文書などからの生物学的相互作用の抽出
OSWindows XP、Windows 2000 / Mac OS X / Linux system
メモリ512MB以上(1GB以上推奨)
ハードディスク使用容量 8GB
    
10日間の試用版(無料)もご用意しています。こちらからダウンロード出来ます。
お求め安く、かつ新バージョンへのアップデート可能な年間ライセンス形態になっております。
3年間ライセンスやFloating Typeも別途ご用意しておりますので、お問い合わせ下さい。
Agilent Technologies社のSTRATAGENEは、ゲノムやプロテオームの生体情報に関連した革新的な製品や技術を開発し、世界のライフサイエンス研究を牽引しています。
開発元のストランドライフサイエンス社はインドのバンガロール(Bangalore)を拠点とし、データマイニング、視覚化、予測モデル、ナレッジ・マネジメント、ワークフロー管理などの技術を駆使して医薬品の研究開発を支援するためのソフトウェアの開発やコンサルティングサービスを行っています。米国カリフォルニアにも営業拠点を持ち、その高度な技術と応用性につき高い評価を得ており、既に、欧米の大手製薬企業やバイオベンチャー企業、大学研究組織などとの契約の実績を誇っております。
STRATAGENE社 
STRATAGENE社:PathwayArchitectTM Software 
Strand Life Sciences社 
Affymetrix Japan
遺伝子発現解析ソフトウェア:ArrayAssist® 
データマイニング受託サービス
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